1.由于自耦變壓器的一次側和二次側有直接的電氣連接，為了防止高壓側單相接地故障引起低壓側電壓升高，電網中使用的自耦變壓器中性點必須可靠地直接接地。

2.由于一次側和二次側直接電氣連接，當高壓側過電壓時，會造成低壓側嚴重過電壓。為了避免這種危險，必須在一次側和二次側安裝避雷器。

3.由于自耦變壓器的短路阻抗比普通干式變壓器小，短路電流比普通干式變壓器大，必要時應采取限制短路電流的措施。

4.運行中注意監視公共繞組的電流，使其過載。如有必要，調整第三繞組的運行方式，以增加自耦變壓器的交換容量。